細菌通過新陳代謝不斷合成菌體成分，此外，還能合成許多在醫(yī)學(xué)上具有重要意義的代謝產(chǎn)物。
（1）熱原質(zhì)
或稱致熱原，是細菌合成的一種注入人體或動物體內(nèi)能引起發(fā)熱反應(yīng)的物質(zhì)，多由革蘭陰性菌產(chǎn)生，熱原質(zhì)即其細胞壁的脂多糖。
熱原質(zhì)耐高溫，高壓蒸氣滅菌（121℃，20min）不被破壞，250℃高溫干烤才被破壞或用吸附劑去除。在制備和注射藥品過程中應(yīng)嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作，防止細菌污染。
（2）毒素和侵襲性酶
外毒素是多數(shù)革蘭陽性菌和少數(shù)革蘭陰性菌在生長繁殖過程中釋放到菌體外的蛋白質(zhì)，毒性強；內(nèi)毒素是革蘭陰性菌細胞壁的脂多糖，當(dāng)菌體死亡崩解后游離出來；某些細菌可產(chǎn)生侵襲性酶，促使細菌擴散。
（3）色素
分水溶性和脂溶性兩種，有助于鑒別細菌。
（4）抗生素
是由某些微生物在代謝過程中產(chǎn)生的一類能抑制或殺死某些其他微生物的物質(zhì)。大多由放線菌和真菌產(chǎn)生。
（5）細菌素
是某些菌株產(chǎn)生的一類具有抗菌作用的蛋白質(zhì)，只對有近緣關(guān)系的細菌有殺傷作用，如大腸菌素。
（6）維生素
腸道內(nèi)大腸埃希菌能合成B族維生素和維生素K，可被人體吸收利用。
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